חוקרי בית הספר להנדסה ולמדעי המחשב באוניברסיטה העברית פיתחו שיטה מתמטית חדשה לזיהוי שיטות ההגנה והבקרה של תאי הגוף. המחקר מתפרסם הערב בכתב העת היוקרתי Nature Genetics
טל איתן, YNET
קישור ישיר לדף זה: https://www.hayadan.org.il/genemath1.html
חוקרי בית הספר להנדסה ולמדעי המחשב של האוניברסיטה העברית מפרסמים הערב (א', 12/5/03) תוצאותיו של מחקר חדשני העוסק בזיהוי שיטתי של מנגנוני בקרה על תהליכים תוך תאיים. המחקר בוצע על ידי קבוצת הביולוגיה החישובית בהנחיית ד"ר ניר פרידמן, בשיתוף פעולה עם ביולוגים וחוקרים מתחום מדעי המחשב מאוניברסיטת סטנפורד ואוניברסיטת תל-אביב.
"מחקר זה מהווה צעד משמעותי לקראת זיהוי אוטומטי של תהליכי ומנגנוני הבקרה בתא בעזרת שיטות חישוביות", אומר ד"ר פרידמן. "אני מקווה כי המחקר יוביל לתגליות שיזרזו פיתוח תרופות למחלות הנגרמות מפגיעה במנגנוני הבקרה של התא כדוגמת מחלת הסרטן המתאפיינת בחלוקה בלתי מבוקרת של תאים.
תוצאות המחקר מהוות קפיצת מדרגה בניתוח נתונים מדעיים ברמת הגנום השלם. החוקרים משתפים פעולה עם ביולוגים בחקר סרטן הריאות וטרשת נפוצה, ומעריכים כי בזכות השיטה החישובית החדשה ניתן יהיה לזהות את מנגנוני הבקרה הפגומים במחלות מסוג זה, וכך למצוא תרופות ופתרונות שיעזרו להתמודד עם המחלה.
המחקר מתבסס על תחום מדעי חדש יחסית הזוכה לפופולאריות רבה בו נתלות תקוות רבות – ביולוגיה חישובית (ביואניפורמטיקה). תחום זה הוא עירוב של נושאים המדעים החישוביים – מתמטיקה, סטטיסטיקה ומחשבים, עם מדעי הרפואה, הביולוגיה והגנטיקה. פרוייקט הגנום האנושי שהושלם לאחרונה הוא דוגמא למחקר מדעי הנמצא בתחום זה, ועירב שיטות חישוביות שונות וניתוח נתונים.
"תחום חדשני זה קיבל תאוצה רבה בעשור הקרוב, עקב פיתוחן של מספר טכנולוגיות למחקר ביולוגי המבצעות מדידות ניסויות בקנה מידה גדול ושאת מסת הנתונים שהן מספקות יש לנתח במחשב", אומר ד"ר פרידמן. "יש להבהיר כי ניתוח ידני אינו יכול להתמודד עם מסת נתונים אדירה ולכן יש צורך בכלי חישובי מתקדם ומורכב".
השיטה החדשה מאפשרת לחוקרים לאתר את מנגנוני ההגנה והפעילות של התאים בגוף, באמצעות שיטות מתמטיות שונות. החוקרים בנו מערכת חישובית המעבדת מידע המועבר לתוכה, וגוזרת ממנו חוקיות ומסקנות לגבי שיטות הפעולה של התאים. המחשב מתייג באופן אוטומטי את תפקודו של כל גן בקרה, הן מבחינת התהליכים להם הוא אחראי והן מבחינת התנאים בהם הוא פועל.
ריכוז ידעני מדעי החיים
