מבצע בינלאומי ייצור מאגר מידע עבור גנטיקאים
הלן ר. פירסון , Nature (תרגום: דיקלה אורן)
קישור ישיר לדף זה: https://www.hayadan.org.il/genomedata0404.html
חוקרים חיברו קטלוג מקיף של מעל ל-21,000 גנים אנושיים – כשלושת רבעי הכמות הכוללת של הגנים המוערכת בגנום שלנו.
מומחים אומרים, כי הקטלוג, שנקרא מאגר המידע המלא של גדילי דנ"א משלים אנושי (Human Full-length Complementary-DNA Annotation Invitational Database ובקיצור H-Invitational Database), יסייע לגנטיקאים לגלות מה תפקידו של כל גן בגוף האדם, וכמו כן את תרומתם של הגנים למחלות מסוימות.
"זהו מקור מידע אדיר," אומר לן פנצ'יו, שחוקר את הגנום האנושי במעבדה הלאומית לורנס ברקלי בקליפורניה (Lawrence Berkeley National Laboratory).
למרות שמרבית רצף הגנום האנושי נמצא כבר בהישג ידם של חוקרים, הם עדיין נאבקים להבין אילו מקטעים הם גנים, שהם חלקי הקוד שנותנים הוראות לייצור חלבונים, ואילו אינם גנים. תוכנות מחשב, שמנסות לחזות אילו חלקים הם גנים, נתגלו כבלתי אמינות.
פרטי המאגר, שהנו פרי עבודתו של צוות בינלאומי ובראשו טקאשי ג'וג'ובורי מהמרכז לביולוגית מידע ובנק המידע לדנ"א של יפן במישימה, מפורסמים ב-Public Library of Science Biology.
ניתוח מערך הגנים כבר הניב כמה ממצאים מעניינים. לדוגמא, ככל הנראה, הרצפים בתחילתם וסופם של הגנים נוטים להיות ארוכים יותר מאלה באמצע הגנים, למרות שאיש אינו יודע מדוע. "משהו מוזר מתרחש בתחילתם ובסופם של הגנים," אומר אוון בירני מהמכון האירופאי לביואינפורמטיקה בהינקסטון, בריטניה.
הצוות יצר את הקטלוג על ידי איחוד של שישה אוספים קיימים של מולקולות, שנקראות דנ"א משלים (Complementary DNA). ניתן לייצר את המולקולות האלה רק מגנים פעילים.
מתוך כ-41,000 קטעי דנ"א משלים, החוקרים פסלו את הכפילויות. כ-120 צוותים נפגשו בטוקיו בקיץ 2002 כדי לבצע את מרבית הניפוי הזה.
מאגר המידע שנוצר מכיל למעלה מ-21,000 גנים, וכמו כן מידע על מקומות פעילותם בגוף, תחזיות לגבי החלבונים שהם יוצרים ומידע על השינויים שחלים בהם ומסייעים להבחין בין אדם אחד למשנהו.
חוקרים יכולים לשלות מידע מהמאגר עצמו, או לחלופין להזמין חלק גדול מקטעי הדנ"א המשלים בדואר.
הפרויקט נמשך מזה שלוש שנים, אך החוקרים אומרים, שהעבודה ממשיכה. "המאגר יראה אחרת בעד שישה חודשים," אומר פנצ'יו.
הכתבה ב-Nature
ידען הגנום האנושי
https://www.hayadan.org.il/BuildaGate4/general2/data_card.php?Cat=~~~824650425~~~48&SiteName=hayadan
