פגישה בין מומחי שני התחומים מנסה להתמודד עם השאלה כיצד מחשבים ימזגו מידע ממחקרים
הלן פירסון, נייצ'ר, (תרגום: דיקלה אורן)
קישור ישיר לדף זה: https://www.hayadan.org.il/nih091103.html
ביולוגים ואנשי טכנולוגיה עורכים מפגש במרילנד כדי לנסות ליצור תוכנה, שעשויה להפוך מידע ממעבדה למשהו שימושי כגון אבחנה. המדענים, שמבלים יומיים במכון הלאומי לבריאות (NIH National Institute of Health) בבתסדה השבוע, רוצים למצוא דרך למזג בין הררי המידע, שפולטים מכונות ריצוף ומודלים ממוחשבים. במצב הנוכחי דרוש מאמץ ניכר כדי לקשר בין הפרופיל הגנטי של מטופל, סריקת המוח שלו והמחקרים הקליניים האחרונים. הדבר משול למחשב אישי פרימיטיבי, שמריץ מעבד תמלילים, תוכנת דואר אלקטרוני וגיליון אלקטרוני לא מתאימים, אומר אריק ג'ייקובסון מהמכון הלאומי למדעי הרפואה הכללים, שעזר לכנס את הפגישה. “אנחנו מפגרים בהרבה מאחור בניסיוננו לגרום לכול לעבוד יחדיו” הוא אומר. הפגישה, שכותרתה ביולוגיה דיגיטלית: הפרדיגמה המתגבשת, באה צמוד להודעתו של ה-NIH, שהוא מתעתד להקים ארבעה מרכזים לאומיים למחשוב ביו רפואי. מנהל NIH, אליאס זרהוני, חשף את התוכניות בחודש האחרון במסמך, שמתאר את האסטרטגיה שלו לטווח הארוך, מפת הדרכים, והזרים 14 מיליון דולר לתקציבי המרכזים.
בעיה מרכזית אחת בהתמודדות עם מחקרים ביו רפואיים היא מיזוג המידע מתחומים וקני מידה שונים. אלה החוקרים את המוח , לדוגמא, משתמשים במודלים ממוחשבים שונים כדי לחקות את המולקולות בתוך תאי העצב, אלה בחיבורים ביניהם (שנקראים סינפסות) ומסלולים שלמים של תאי העצב. אולץ ספורנס, מאוניברסיטת אינדיאנה בבלומינגטון, מוביל צוות אחד, שמנסה להבין כיצד התהליכים הללו מכוונים מידע הלכה למעשה. הם בנו רובוט בעל גלגלים, שמונע בידי מוח מתוכנת ולומד, בעודו רואה את הנעשה סביבו בעזרת מצלמה ונוגע בדברים בעזרת ידיים. “אנו יכולים לחקור אותו כמו בעל חיים” אומר ספורנס. כמה מושבים בפגישת הביולוגיה הדיגיטלית ידונו בדרכים לבניית תשתית להתמודדות עם בעיות חישוביות כבדות כגון המספר המדהים של הדרכים בהן 100,000 או יותר החלבונים בתא עשויים להתחבר. תשתית כזו יכולה לנצל צבא של מחשבים אישיים בזמן בו הם אינם מבצעים כל פעולה או מחשבי על, שמחוברים ביניהם כמו ה”גריד”. מארק אליסמן מאוניברסיטת קליפורניה, סאן דייגו, ועמיתיו בנו אב טיפוס של רשת כזו. הרשת, שנקראת רשת המחקר למחקר ביו רפואי ואינפורמטיקה, כוללת שישה עשר מחשבים אישיים ממכונים שונים. במחקר אחד, חוקרים חולקים ומשווים סקירות מוח של חולי סכיזופרניה במטרה לאבחן את המחלה טוב יותר. הדיון הפומבי הוא הסיום של שבוע של אירועי ביולוגיה דיגיטלית. בפגישה עם יושבת בראש השותפה קרן סקינר מהמכון הלאומי לשימוש יתר בסמים מקווה להפיק דיווח בחודשים הקרובים, שידגיש את השאלות שנידונו. “זהו אתגר גדול” היא אומרת.
https://www.hayadan.org.il/BuildaGate4/general2/data_card.php?Cat=~~~683069660~~~48&SiteName=hayadan
