כמעט מחצית מהאקוסיסטמות (מערכות אקולוגיות) נמצאות במצב גרוע. שינויים באקלים, החמצה של המים (עלייה בריכוז החומצה במים), פיתוח חופים ויתר-דייג- כל אלה ממשיכים להוות איום משמעותי למערכות האקולוגיות הימיות
שוניות אלמוגים (כמו גם יערות הגשם הטרופיים) הם מהמערכות האקולוגיות המורכבות והעשירות ביותר בעולם. השוניות חשובות לאדם הן משום שהן מגינות על אזורי החוף מפני סערות וכן מהוות בית למיליון מינים של דגים וחסרי חוליות, והן משום שהן עשויות לשמש בפיתוח תרופות ומשאבים אחרים לאנושות.
שונית האלמוגים בנויה ממושבה של מיליוני בעלי-חיים הנקראים אלמוגים. האלמוגים הם חסרי-חוליות ישיבים (צמודים למצע), השייכים למערכת הנבוביים, (למערכת זו גם המדוזות). גופם של האלמוגים נקרא פוליפ, והם מפרישים סביב עצמם שלד גירני הדומה לסלע. האלמוגים הם יצורים טורפים, הניזונים מזואופלנקטון, ולשם כך הם מצוידים בזרועות ציד.
על רוב שוניות האלמוגים בעולם מאיימת סכנת הכחדה וזאת בשל התערבות האדם וזיהום הסביבה. אחד האיומים על קיומן של השוניות הוא עליית הטמפרטורה בעולם (התחממות גלובלית). האלמוגים סובלים גם מבנייה בחופים, מהזרמת ביוב ביתי ותעשייתי לים, מדליפות נפט, משבירת חלקים מהשונית (מכוונת או אקראית) ועוד.
אלמוג זה, המופיע בצילום, משונית קינגמן מותקף ע”י כוכב ים פולשני הקרוי כוכב “כתר קוצים”. אולם לגבי רוב השונית, שונית דרום פסיפית זו נשמרת במצב מעולה… זוהי אחת מנקודות האור במחקר אנליטי חדש של שוניות האלמוגים בגבולות ארצות הברית. לפי דו”ח מחקר זה, אשר פורסם ב-7 ביולי 2008, האיכות הממוצעת של רוב המשאבים בשונית- אלמוגים, דגים, איכות מים- ממשיכה לרדת.
כמעט מחצית מהאקוסיסטמות (מערכות אקולוגיות) נמצאות במצב גרוע. שינויים באקלים, החמצה של המים (עלייה בריכוז החומצה במים), פיתוח חופים ויתר-דייג- כל אלה ממשיכים להוות איום משמעותי למערכות האקולוגיות הימיות.
שני מינים של אלמוגים, המכונים elkhorn ו- staghorn הוכרזו רשמית כמינים בסכנת הכחדה
