ידענים: ביולוגיה ורפואה | גנטיקה

מאת 5 בינואר 2017 אין תגובות

מכון סנגר, מכון מחקר המוביל במחקרי רצף הגנום ומחקר גנטי, מאמץ את פלטפורמת Red Hat OpenStack ו-Red Hat CloudForms כדי לספק פתרונות מחשוב ענן בעלי אמינות גבוהה ביותר ויכולות גידול מרביים, שישפרו את היכולת לשתף מחקרים מדעיים עתירי נתונים.

איור: pixabay.com.

איור: pixabay.com.

רד האט (Red Hat), הספקית הגדולה בעולם של פתרונות קוד פתוח, הודיעה כי מכון סנגר (Wellcome Trust Sanger), מוביל עולמי במחקר הגנום, ביסס כסטנדרט את מערכות ושירותי מחשוב הענן שלו על פלטפורמת Red Hat OpenStack ו-Red Hat CloudForms. הדבר יאפשר למכון לספק ולנהל ביתר יעילות מחשוב מדעי בהיקף גדול, או "מדע-כשירות" (Science-as-a-Service) עבור חוקרים שלו וסטארט-אפים בתחום הביוטכנולוגיה, השוכנים יחד במתקן מחקר חדש בקמפוס Wellcome Genome.

מכון סנגר מקיימברידג' בבריטניה, המכונה על שם הביוכימאי פרדריק סנגר, משמש כמרכז מחקר עולמי לתגליות גנומיות, ומשתף פעולה עם חברות סטארט-אפ, יצרניות תרופות, ממשלות ומרכזי מחקר אחרים. מעצם טבעה עבודת המכון היא עתירת נתונים, מאחר שהארגון יוצר רצפי מספרים גדולים של דגימות דנ"א כדי לחפש שונויות, וצריך את היכולת להפוך תוצאות אלה לנתונים נגישים וניתנים לשיתוף עבור פרויקטי מחקר גלובליים נוספים.

במטרה להשיג את עוצמת המחשוב הנדרשת למשימות אלה, הסתמך מכון סנגר באופן מסורתי על תשתית אשכולות מחשוב (clusters), אך לזו חסרה גמישות ולא התאימה לשיתוף פעולה עם ארגונים אחרים. הרצון לשיתוף פעולה הפך במהירות להכרח, מאחר שהמכון רצה לעבוד באופן צמוד יותר עם מספר סטארט-אפים בתחום הביוטכנולוגיה הפועלים בקמפוס שלו. שיפור יכולות של המשתמשים פנימיים וחיצוניים להריץ עומסי עבודה הטרוגניים בסביבה בטוחה ומאובטחת יותר, היכולות להקצות משאבים בלחיצת כפתור יחידה. באמצעות היצע זה של Science-as-a-Service, רצה מכון סנגר לפשט שיתוף פעולה בעולם ובקמפוס שלו. אתגר זה חייב לשפר את תשתיות המחשוב שלו.

המכון רצה לבסס את ההיצע שלו על סטנדרטים פתוחים וטכנולוגיות קוד פתוח, כולל OpenStack כתשתית ענן פרטי והיברידי. המכון חיפש שותף שיסייע לתמיכה בתשתית זו אשר יהיה בעל ניסיון בהקמת פריסות בקנה מידה גדול בתוך זמן קצר. היות והמכון פתח מכון מחקר חדש הוא העמיד לוח זמנים אגרסיבי להקמת השרות החדשני. לקבלת מענה לכל צרכים אלה, פנה מכון סנגר לרד האט, הספקית הגדולה בעולם של פתרונות קוד פתוח, ואחת התורמות הגדולות ביותר לפרויקט OpenStack.

טים קאטס.

טים קאטס.

ד"ר טים קאטס, מנהל מחשוב מדעי במכון סנגר, אמר: "פלטפורמת Red Hat OpenStack מאפשרת למשתמשים ליצור ולשתף מכונה וירטואלית של המחקרים שלהם, וכדי למצוא ולהעביר מכונות וירטואליות מכל מקום אחר. המשמעות היא שאנו מסוגלים לבצע אנליזות מסובכות על נתונים ברחבי העולם, עם הביטחון שאנחנו יכולים לענות על הצרכים של שלמות נתונים ומשילות. בנוסף, Red Hat CloudForms משמש לניהול סביבת ענן היברידי מורכבת זו, ולאספקת חוויית משתמש איכותית יותר".

קטלוג השירות של המכון, המבוסס על פלטפורמת Red Hat OpenStack, מציע למשתמשים פנימיים ולחברות השוכנות בקמפוס הסכמי רמת שירות שונים (זהב, כסף וברונזה), שכל אחד מהם מציע תמהיל שונה של שירותים ויישומים כדי לעזור לענות על צרכים מדעיים ייחודיים. בנוסף משתמש מכון סנגר בפתרון ניהול ענן היברידי Red Hat CloudForms שזכה בפרסים רבים, כדי לפקח ולשלוט על סביבה מורכבת זאת, ולספק חוויית משתמש רציפה.

גוף הייעוץ של רד האט עבד בשיתוף פעולה הדוק עם מומחי מחשוב מדעי במכון סנגר, כדי לעזור בהטמעת הפתרון החדש המבוסס על OpenStack עבור פתיחת המתקן החדש. בפני גוף הייעוץ של רד האט הוצב האתגר של מגבלת זמן של שלושה חודשים בלבד כדי לבנות ולהשיק את הפתרון. ארגון הייעוץ של רד האט העמיד לרשות המכון את הידע והניסיון שנדרשו לא רק לעמידה בלוח הזמנים, אלא גם לקביעת נהלים סביב התשתית החדשה, וסיוע בהטמעת השירותים הנלווים דוגמת אינטגרציית CloudForms, חיוב לפי שימוש, וניהול חשבונות הסטארט-אפים בקמפוס.

טים ייטון.

טים ייטון.

היצע Science-as-a-Service של המכון הותקן ופעיל עתה באופן מלא, ומשרת חמישה סטארט-אפים במתקן המחקר החדש. קטלוג המכון כולל שלושה פטה-בייט (1000 טרה-בייט) של נפח אחסון, 6,000 ליבות מעבדים וקישוריות 100 Gigabit, תוך יכולת להרחיב יכולות אלה עם פרויקטים חדשים והזדמנויות לשיתוף פעולה.

טים ייטון, סגן נשיא בכיר בקבוצת תשתיות עסקיות ברד האט, אמר: "פלטפורמת Red Hat OpenStack ו-Red Hat CloudForms מאפשרות לארגונים לבנות ולנהל ארכיטקטורת ענן היברידי בעל יכולת התרחבות עצומה, המתאימה ביותר לצרכים הייחודיים שלהם הודות לאופי הגמיש של קוד פתוח. אנו שמחים על כך שמכון סנגר ביסס את ההיצע החדש שלו על פתרונותינו, ומצפים לתמוך במאמצי המכון תוך שימוש בפתרונות אלה לסלול דרכים חדשות במחקר הגנום האנושי".

עוד באתר הידען

הוספת תגובה

  • (will not be published)